Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gps1Q99LD4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gps1Q99LD4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms