Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf34Q99KR6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf34Q99KR6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf34Q99KR6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms