Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdxdc1Q99K01 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdxdc1Q99K01 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms