Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim7Q923T7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trim7Q923T7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms