Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrif1Q923B3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrif1Q923B3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrif1Q923B3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms