Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NelfcdQ922L6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NelfcdQ922L6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NelfcdQ922L6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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