Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubb6Q922F4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb6Q922F4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb6Q922F4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms