Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y00

Pcdhb2, Protocadherin beta 2, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb2Q91Y00 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb2Q91Y00 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb2Q91Y00 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb2Q91Y00 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb2Q91Y00 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb2Q91Y00 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb2Q91Y00 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb2Q91Y00 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb2Q91Y00 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdhb2Q91Y00 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb2Q91Y00 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms