Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vps4aQ8VEJ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps4aQ8VEJ9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps4aQ8VEJ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps4aQ8VEJ9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps4aQ8VEJ9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vps4aQ8VEJ9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps4aQ8VEJ9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps4aQ8VEJ9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps4aQ8VEJ9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps4aQ8VEJ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps4aQ8VEJ9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vps4aQ8VEJ9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms