Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rpap2Q8VC34 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpap2Q8VC34 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms