Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg10Q8R1P4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atg10Q8R1P4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg10Q8R1P4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms