Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CipcQ8R0W1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CipcQ8R0W1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CipcQ8R0W1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CipcQ8R0W1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CipcQ8R0W1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CipcQ8R0W1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CipcQ8R0W1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms