Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssh3Q8K330 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssh3Q8K330 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms