Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr1eQ8K202 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Polr1eQ8K202 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 528.8 ms