Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFH6

Sik2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik2Q8CFH6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik2Q8CFH6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sik2Q8CFH6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sik2Q8CFH6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms