Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrif1Q8CDD9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrif1Q8CDD9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Lrif1Q8CDD9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrif1Q8CDD9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
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