Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc159Q8C963 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc159Q8C963 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc159Q8C963 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms