Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dclre1bQ8C7W7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dclre1bQ8C7W7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dclre1bQ8C7W7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms