Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y2

Gm9999, Predicted gene 9999, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9999Q8C5Y2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm9999Q8C5Y2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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Gm9999Q8C5Y2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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Gm9999Q8C5Y2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Gm9999Q8C5Y2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm9999Q8C5Y2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm9999Q8C5Y2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm9999Q8C5Y2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm9999Q8C5Y2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm9999Q8C5Y2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm9999Q8C5Y2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm9999Q8C5Y2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm9999Q8C5Y2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm9999Q8C5Y2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm9999Q8C5Y2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm9999Q8C5Y2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm9999Q8C5Y2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm9999Q8C5Y2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm9999Q8C5Y2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm9999Q8C5Y2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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