Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfrp1Q8C4U3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms