Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc60Q8C4J0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc60Q8C4J0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc60Q8C4J0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc60Q8C4J0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms