Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc30Q8BVF4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc30Q8BVF4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc30Q8BVF4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms