Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdcl3Q8BVF2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcl3Q8BVF2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pdcl3Q8BVF2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms