Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLA8

Trpa1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpa1Q8BLA8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpa1Q8BLA8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpa1Q8BLA8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpa1Q8BLA8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms