Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX0

4933402J07Rik, RIKEN cDNA 4933402J07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402J07RikQ8BHX0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933402J07RikQ8BHX0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4933402J07RikQ8BHX0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933402J07RikQ8BHX0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms