Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGS3

Zkscan1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan1Q8BGS3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zkscan1Q8BGS3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zkscan1Q8BGS3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zkscan1Q8BGS3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zkscan1Q8BGS3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zkscan1Q8BGS3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zkscan1Q8BGS3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zkscan1Q8BGS3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zkscan1Q8BGS3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zkscan1Q8BGS3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zkscan1Q8BGS3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zkscan1Q8BGS3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zkscan1Q8BGS3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Zkscan1Q8BGS3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zkscan1Q8BGS3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zkscan1Q8BGS3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zkscan1Q8BGS3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zkscan1Q8BGS3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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