Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Necab1Q8BG18 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Necab1Q8BG18 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Necab1Q8BG18 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Necab1Q8BG18 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Necab1Q8BG18 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Necab1Q8BG18 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms