Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim65Q8BFW4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim65Q8BFW4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim65Q8BFW4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms