Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snd1Q78PY7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snd1Q78PY7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snd1Q78PY7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snd1Q78PY7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms