Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd3eapQ76KJ5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd3eapQ76KJ5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms