Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rph3alQ768S4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rph3alQ768S4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms