Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1cQ6PDZ2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1cQ6PDZ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1cQ6PDZ2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms