Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp2d40Q6P8N9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp2d40Q6P8N9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp2d40Q6P8N9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms