Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcnpQ6P8I4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PcnpQ6P8I4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PcnpQ6P8I4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PcnpQ6P8I4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PcnpQ6P8I4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnpQ6P8I4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnpQ6P8I4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnpQ6P8I4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PcnpQ6P8I4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms