Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc189Q6NZQ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc189Q6NZQ0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc189Q6NZQ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc189Q6NZQ0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc189Q6NZQ0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc189Q6NZQ0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc189Q6NZQ0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms