Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggnbp1Q6K1E7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggnbp1Q6K1E7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms