Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn11Q6J756 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Capn11Q6J756 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Capn11Q6J756 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms