Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms