Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arhgap20Q6IFT4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap20Q6IFT4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms