Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Otud6aQ6IE21 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud6aQ6IE21 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otud6aQ6IE21 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otud6aQ6IE21 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otud6aQ6IE21 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud6aQ6IE21 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud6aQ6IE21 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud6aQ6IE21 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud6aQ6IE21 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud6aQ6IE21 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud6aQ6IE21 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud6aQ6IE21 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud6aQ6IE21 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud6aQ6IE21 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms