Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pan3Q640Q5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pan3Q640Q5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pan3Q640Q5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pan3Q640Q5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pan3Q640Q5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pan3Q640Q5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pan3Q640Q5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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