Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup62Q63850 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup62Q63850 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.2 ms