Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift88Q61371 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift88Q61371 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift88Q61371 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift88Q61371 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift88Q61371 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift88Q61371 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift88Q61371 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift88Q61371 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift88Q61371 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift88Q61371 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift88Q61371 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift88Q61371 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ift88Q61371 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ift88Q61371 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ift88Q61371 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ift88Q61371 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift88Q61371 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift88Q61371 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms