Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mre11Q61216 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mre11Q61216 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms