Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc9a1Q61165 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9a1Q61165 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9a1Q61165 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms