Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyb561Q60720 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyb561Q60720 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyb561Q60720 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms