Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc27a1Q60714 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc27a1Q60714 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc27a1Q60714 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms