Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm1Q60636 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm1Q60636 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm1Q60636 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm1Q60636 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms