Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Specc1Q5SXY1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Specc1Q5SXY1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Specc1Q5SXY1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Specc1Q5SXY1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.1 ms