Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znrf3Q5SSZ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znrf3Q5SSZ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znrf3Q5SSZ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms