Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otol1Q4ZJM7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Otol1Q4ZJM7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms